Las Academias son órganos colegiados propositivos, que tienen por objeto fortalecer las tareas sustantivas de docencia, investigación, desarrollo, innovación y vinculación, tendientes a elevar la calidad educativa del Tecnológico. 
Dentro de las funciones de las academias está: 
- Revisar y actualizar los contenidos de las materias que correspondan a su
disciplina.  - Programar y validar por períodos la impartición de los contenidos temáticos de
los programas de estudio de la asignatura de que se trate, así como las
actividades y proponer medidas para su coordinación en el semestre. - Proponer los métodos, técnicas y recursos didácticos que faciliten el proceso
enseñanza-aprendizaje de la asignatura o asignaturas de que se trate y vigilar
su acertada aplicación.  - Promover la elaboración de prototipos, software o materiales audiovisuales y
didácticos en apoyo a la docencia.  - Determinar y evaluar los avances del programa o programas de la o las
asignaturas de que se trate, así como las actividades académicas y proponer
medidas para su coordinación y fortalecimiento.  - Sugerir la mejor aplicación de las normas y procedimientos para la evaluación
del aprendizaje y procurar la correlación armónica con las demás asignaturas.  - Presentar a la jefatura correspondiente para su aprobación, la propuesta de los
indicadores de evaluación de cada una de las asignaturas que correspondan.  - Proponer las medidas conducentes para elevar la eficiencia terminal. 
- Participar en los programas de vinculación, servicio social, tutorías, residencias
profesionales y servicio externo.  - Proponer las medidas pertinentes para la actualización profesional, superación
académica y capacitación didáctica de cada uno de sus integrantes.  - Proponer a la jefatura las necesidades de equipamiento y actualización de los
laboratorios respectivos.  - Actualizar permanentemente la bibliografía básica o complementaria de los
programas de estudio de cada asignatura y solicitar su adquisición.  - Presentar a la Jefatura, anualmente, la propuesta del programa editorial. 
- Fortalecer las líneas de investigación y desarrollo en áreas científicas,
tecnológicas y educativas. 
Las asignaturas que se imparten en la carrera de Ingeniería Bioquímica están distribuidas en seis academias: 
- Academia de Fisico-Matématicas. 
- Academia de Química. 
- Academia de Bioquímica. 
- Academia de Ciencias de la Ingeniería. 
- Academia de Ingeniería Aplicada. 
- Academia de Ciencias Economicoadminitrativas y Sociohumanísticas.